83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1658 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  100 
 
 		 413 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  82.32 
 
 		 413 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  69.6 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  69.49 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  53.9 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  47.22 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  47.22 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  48.18 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  45.94 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  36.66 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.87 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  35.21 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.42 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.55 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.55 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  29.7 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.54 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.88 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.43 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.22 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  27.17 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  27.17 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  28.2 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  28.2 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  28.2 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.14 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.18 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  28.06 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  27.01 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  29.32 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  29.32 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  29.32 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  29.32 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  29.32 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  29.32 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  26.27 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  28.25 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  27.22 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.7 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 611 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  26.71 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  27.72 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  27.72 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  28.53 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  25.07 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  28.27 
 
 		 652 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  24.64 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  27.17 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.13 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  26.78 
 
 		 483 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.65 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  26.74 
 
 		 569 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  25.31 
 
 		 579 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.66 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  26.58 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  25.49 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  25.37 
 
 		 590 aa  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  22.13 
 
 		 585 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  24.71 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  21.47 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  26.87 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  24.79 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.87 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  25.14 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  23.12 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  21.18 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  23.95 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  21.31 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.78 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  20.22 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>