84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0713 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  100 
 
 		 415 aa  847    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.66 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.78 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.78 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.41 
 
 		 448 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.56 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  29.72 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.75 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.8 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.81 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.22 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.01 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.11 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  27.61 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.26 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.65 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.82 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.82 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.88 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  25.76 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.93 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 611 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.97 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.04 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.06 
 
 		 413 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  23.14 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  23.14 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  23.14 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  24.38 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  24.51 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  25.07 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  25.88 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  23.18 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  25.14 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  25.14 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  24.38 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  21.64 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  21.37 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  24.73 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.46 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  27.25 
 
 		 585 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  23.56 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 515 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  23.35 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  25.2 
 
 		 590 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  24.52 
 
 		 579 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  23.88 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  23.39 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  24.45 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  22.75 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  24.06 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  20.82 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  23.1 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.1 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  22.9 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  20.45 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  22.13 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  22.28 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  20.44 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1087  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0085  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0101  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 760 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2689  chain length determinant family protein  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2840  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.540822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1525  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1245  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.46 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>