96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1304 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  100 
 
 		 360 aa  717    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  43.75 
 
 		 368 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  41.59 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  37.36 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  31.46 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  31.35 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  31.35 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  30.56 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  30.56 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  30.56 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  30.14 
 
 		 371 aa  179  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.54 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  26.2 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.42 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.42 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  32 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  30.19 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  28.86 
 
 		 483 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.57 
 
 		 436 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  27.27 
 
 		 515 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  27.27 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  27.27 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  27.27 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  27.27 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  27.27 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.58 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  25.89 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.41 
 
 		 416 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  30.77 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  29.83 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  27.42 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  27.81 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  27.35 
 
 		 569 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  27.3 
 
 		 413 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.95 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  27.04 
 
 		 652 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  21.64 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.81 
 
 		 433 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.77 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  28.25 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  28.33 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  28.73 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.04 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 415 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  30.77 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.76 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.76 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.1 
 
 		 448 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.65 
 
 		 414 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  25.85 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  24.1 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  22.69 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  23.1 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.14 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.5 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.9 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  24 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  26.35 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  21.82 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.44 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  23.73 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.15 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  23.85 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.18 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  28.07 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  24.06 
 
 		 750 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.48 
 
 		 461 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.53 
 
 		 740 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.33 
 
 		 740 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  25.76 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  23.53 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  22.54 
 
 		 740 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.73 
 
 		 711 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.27 
 
 		 726 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  22.19 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.78 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 		 800 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 653 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  27.84 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 474 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.93 
 
 		 730 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  24.3 
 
 		 745 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>