79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2574 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 371 aa  751    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  100 
 
 		 371 aa  751    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  46.83 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.77 
 
 		 385 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  47.7 
 
 		 388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  44.2 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  44.2 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  42.28 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  42.28 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  42.28 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  42.28 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  42.28 
 
 		 465 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  42.28 
 
 		 515 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  45.92 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  44.72 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  41.21 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  40.59 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.82 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  35.87 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  31.02 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  34.35 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.53 
 
 		 436 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  29.07 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.43 
 
 		 443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  33.52 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.98 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  27.15 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.81 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.07 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.06 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  33.05 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.56 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  25.87 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  25.87 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.1 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  26.12 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  26.12 
 
 		 378 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  26.15 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  27.17 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  28.33 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.3 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.3 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.22 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  29.53 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 611 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  26.13 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  26.7 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.82 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  25.73 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.42 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.49 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  23.29 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  25.27 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.02 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  25.71 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.52 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 491 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  26.45 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  26.48 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  23.86 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  25.92 
 
 		 652 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.66 
 
 		 421 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.63 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  26.76 
 
 		 590 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  25.85 
 
 		 585 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.62 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.69 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  24.72 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  23.16 
 
 		 579 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  23.66 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  22.08 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  20.43 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>