89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0746 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  100 
 
 		 365 aa  726    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  48.08 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  46.3 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  46.3 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  43.77 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  42.82 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  42.82 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  42.82 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  42.82 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  42.82 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  42.82 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  45.08 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  43.96 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  42.62 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  42.74 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.17 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  40.87 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.87 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  34.35 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  35.47 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  30.92 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  30.68 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  34.25 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.96 
 
 		 436 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.79 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  34.07 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  29.44 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.95 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  31.13 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.84 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  28.93 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.46 
 
 		 433 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.49 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  25.28 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  23.53 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  25.49 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  27.58 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  28.13 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  24.09 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  24.09 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 611 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.65 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.18 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.18 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.08 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.67 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.46 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.79 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  22.69 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  22.69 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  22.69 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.27 
 
 		 413 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  24.73 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 		 483 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.89 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.13 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  27.56 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  26.1 
 
 		 585 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  27.56 
 
 		 652 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.68 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.68 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.3 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  26.01 
 
 		 569 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 		 387 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 491 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  25.93 
 
 		 579 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  24.37 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.48 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  23.36 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  21.37 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  23.37 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.45 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  30.07 
 
 		 755 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  27.03 
 
 		 744 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.08 
 
 		 739 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.52 
 
 		 741 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.44 
 
 		 739 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.44 
 
 		 739 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  19.83 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.44 
 
 		 739 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  24.53 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.05 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 684 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  24.32 
 
 		 740 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>