41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1355 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1069    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  58.82 
 
 		 1363 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.81 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  56.71 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  53.26 
 
 		 420 aa  179  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  41.18 
 
 		 184 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.24 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.04 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1009 aa  105  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1002 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1025 aa  93.2  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 757 aa  90.1  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  24.36 
 
 		 2821 aa  80.9  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.52 
 
 		 1527 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  29.37 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1557 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  27.3 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  26.83 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  27.7 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  24.56 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  29.21 
 
 		 1475 aa  55.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  27.08 
 
 		 817 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.35 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.74 
 
 		 2495 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 753 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  25.36 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  25.13 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  26.11 
 
 		 330 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  28.22 
 
 		 502 aa  50.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  22.64 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.65 
 
 		 811 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  31.29 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.18 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  25.53 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  27.39 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  36.36 
 
 		 1514 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  21.45 
 
 		 762 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  23.53 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  25.95 
 
 		 697 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  27.16 
 
 		 342 aa  43.5  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>