More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1192 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  200  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  71.29 
 
 
104 aa  147  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  70.3 
 
 
104 aa  146  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  71.29 
 
 
104 aa  146  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  72.82 
 
 
156 aa  145  1e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  72.73 
 
 
99 aa  145  2e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 
102 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 
102 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  136  8e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
102 aa  133  7e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
102 aa  133  7e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
102 aa  133  7e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 
102 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.16286e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  66.67 
 
 
100 aa  129  1e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.39901e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 
102 aa  127  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.76664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 
102 aa  127  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.5429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  59.41 
 
 
102 aa  120  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  116  8e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  115  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  56.73 
 
 
104 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
100 aa  112  2e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  57.43 
 
 
105 aa  112  2e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  111  4e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  54.9 
 
 
103 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  55.77 
 
 
104 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  110  8e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  109  1e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
114 aa  107  4e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
132 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
100 aa  104  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
99 aa  103  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.04369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
102 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
103 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.2148e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  49 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
138 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
105 aa  97.1  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>