More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1067 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 609 aa  1231    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  61.41 
 
 		 608 aa  736    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 		 614 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 		 614 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  37.82 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  36.91 
 
 		 609 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.07 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.91 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  36.91 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  36.87 
 
 		 609 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  32.89 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.11 
 
 		 484 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 402 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 401 aa  124  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 		 402 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 416 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 751 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.39 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 389 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 389 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.5 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  23.4 
 
 		 406 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  27.42 
 
 		 387 aa  88.6  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 406 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 		 530 aa  87.8  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 		 386 aa  87.4  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 378 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.38 
 
 		 379 aa  86.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.33 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 688 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.43 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 719 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.33 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 722 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 		 709 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.15 
 
 		 352 aa  80.1  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  25.06 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.27 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.19 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.54 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  22.73 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  24.77 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  23.64 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.79 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.79 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.79 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  25.15 
 
 		 716 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.79 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  21.64 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.79 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  22.61 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  22.99 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  24.69 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  23.18 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.81 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.69 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  23.05 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  22.26 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  22.61 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  22.61 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  23.78 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.33 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  22.3 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.48 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  22.22 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>