45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1837 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  60.73 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  55.12 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  53.33 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  54.43 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  52.42 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  52.61 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  36.07 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  35.32 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  35.02 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  31.33 
 
 		 244 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  35.59 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  34 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  31.05 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  33.19 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.05 
 
 		 335 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  31.15 
 
 		 329 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  31.88 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  34.57 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  34.98 
 
 		 328 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  32.16 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  29.44 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  31.28 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.24 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  28.69 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  29.17 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  32.9 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  27.47 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  22.08 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  32.93 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  31.43 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  22.08 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  23.55 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  26.36 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  28.16 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  25.21 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  22.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  23.01 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  23.2 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  26.46 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  23.85 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  24.79 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  34.39 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>