More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1010 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  84.97 
 
 		 286 aa  457  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  73.17 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  72.47 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  73.14 
 
 		 278 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  65.86 
 
 		 283 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  63.92 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  61.17 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  60.28 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  55.48 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  54.2 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.83 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.41 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  53.12 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  49.3 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  48.6 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  51.05 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  50.71 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  49.83 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  51.43 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  47.93 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  48.25 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  52.14 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  47.72 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  47.72 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  49.47 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  47.72 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  47.72 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  49.46 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  50.88 
 
 		 278 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  46.44 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  46.85 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  47.83 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  46.5 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  46.55 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  46.34 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  47.57 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  46.5 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  46.5 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  46.32 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 		 271 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.3 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  45.86 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  45.45 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  43.73 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  46.67 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  46.67 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  42.18 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  45.67 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  46.15 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  46.34 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  44.06 
 
 		 275 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  45.83 
 
 		 274 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  45.8 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  43.55 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  45.64 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  45.99 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  45.3 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  45.8 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  46.48 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  44.41 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  44.41 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  43.36 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  44.29 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  43.71 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  47.08 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.09 
 
 		 356 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  43.94 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  43.21 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  45.45 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  43.9 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  43.94 
 
 		 279 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  45.3 
 
 		 273 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  44.6 
 
 		 274 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  45.64 
 
 		 272 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  42.66 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  42.51 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  43.01 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  41.67 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  40.06 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.41 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  64.57 
 
 		 404 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  44.56 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  41.37 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  47.16 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  47.16 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  43.75 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  43.01 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  46.13 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  42.96 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  41.61 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  42.31 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>