More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0334 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  333  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  53.66 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  55.56 
 
 		 179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  52.98 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  47.53 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  48.65 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  56.64 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  50.62 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  47.26 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  45.16 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  46 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.3 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  48.92 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  48.23 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  48.23 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  42.38 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  42.38 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  47.52 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  43.84 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  46.21 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  43.71 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  41.46 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  42.36 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.75 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  40.13 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  41.5 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  39.49 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  48.12 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  41.38 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  48.12 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.4 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.62 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  38.89 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.84 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  45.95 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40.94 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  37.34 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  43.75 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  46.62 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  39.6 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  42.54 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  41.1 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  38.71 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  40.24 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  35.62 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  43.85 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  31.93 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  41.84 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  41.84 
 
 		 191 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.93 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.59 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  32.68 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  32.68 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.68 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  41.78 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.18 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.23 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  32.88 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.67 
 
 		 163 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  29.68 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  36.62 
 
 		 155 aa  97.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  28.57 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  29.68 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.3 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  35.95 
 
 		 160 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.57 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  39.1 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.69 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.85 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  32 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  38.35 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  35.95 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  32.48 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.75 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  32 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  34.04 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  37.32 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  31.37 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  39.71 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.33 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  32.48 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>