More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0954 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0954  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  100 
 
 		 390 aa  815    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000745155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  39.5 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  39.5 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  39.9 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  40.4 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  40.15 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  40.15 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  39.5 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  39.5 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  39.5 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  39.75 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  40.91 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  40.2 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  39.37 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7855  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.25 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  32.31 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  32.51 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.15 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  32.74 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  32.48 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  30.87 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  32.23 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  31.97 
 
 		 502 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.23 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  31.2 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.85 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  32.12 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  30.95 
 
 		 382 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.97 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  31.97 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  31.46 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  30.93 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  31.43 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  30.38 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  30.23 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  32.23 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8006  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.21 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  30.87 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  30.99 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02060  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  34.29 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  31.7 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.49 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  31.19 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  29.17 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  28.57 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  32.29 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.4 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  31.51 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  30.47 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4412  galactonate dehydratase  30.28 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.737612  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  30.47 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  30.47 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  29.09 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.74 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.5 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  31.69 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  30.3 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  29.52 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  30.69 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.42 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  29.95 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  29.92 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  30.21 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  30.21 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.09 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.34 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.89 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.21 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  29.89 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>