More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0075 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  100 
 
 
296 aa  599  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  57.91 
 
 
296 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  56.52 
 
 
297 aa  325  6e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  55 
 
 
298 aa  308  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  52.84 
 
 
299 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  42.09 
 
 
304 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  40.94 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  38.87 
 
 
397 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  39.86 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  38.14 
 
 
282 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  40.74 
 
 
299 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  40.59 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  41.41 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  41.1 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  37.21 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  40.97 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  39.2 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  43.1 
 
 
285 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  37 
 
 
287 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  38.44 
 
 
282 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  40.59 
 
 
281 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  37.59 
 
 
282 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  41.18 
 
 
295 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  38.23 
 
 
313 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  38.28 
 
 
285 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  37.24 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  39.85 
 
 
286 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  39.18 
 
 
284 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  41.74 
 
 
274 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  38.23 
 
 
283 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  36.9 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  36.9 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  36.9 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  38.38 
 
 
296 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  38.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  35.86 
 
 
296 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  39.25 
 
 
312 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
296 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  37.73 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  39.93 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  36.52 
 
 
288 aa  188  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  35.84 
 
 
283 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  42.01 
 
 
287 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  38.98 
 
 
286 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  39.38 
 
 
286 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  38.31 
 
 
305 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  36.86 
 
 
306 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  36.55 
 
 
285 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  38.49 
 
 
284 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  38.64 
 
 
280 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  38.75 
 
 
285 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  41.26 
 
 
287 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  38.6 
 
 
285 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  38.28 
 
 
286 aa  185  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  37.5 
 
 
318 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  38.87 
 
 
293 aa  185  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  38.31 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  40.31 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  39.1 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  37.2 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  38.31 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  38.31 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  36.52 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  36.86 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  39.93 
 
 
285 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  39.12 
 
 
285 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  37.04 
 
 
293 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  37.64 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  38.6 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  37.2 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  38.14 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 
325 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  38.01 
 
 
289 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 
325 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  37.63 
 
 
343 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  36.45 
 
 
290 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  37.17 
 
 
280 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  35.59 
 
 
321 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  37.24 
 
 
286 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
296 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  37.41 
 
 
279 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  42.98 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  37.11 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  36.49 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 
285 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  36.86 
 
 
319 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  40.51 
 
 
280 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>