More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A34 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  51.46 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.76 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  43.81 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.72 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.23 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.18 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  38.46 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  46.81 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  47.27 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  42 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  41.18 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  47.37 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.82 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  45.63 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  43.64 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.44 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.59 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.74 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  42.72 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  37.25 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  41.51 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.43 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  42.73 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  40.91 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  41.12 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  45.28 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  40.91 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.66 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  44.34 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.45 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  39.62 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  40.38 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  40.2 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  42.16 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  37.27 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  44.34 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  42.72 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  43.4 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  40.91 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  38.83 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  38.83 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40.57 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  41 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  39.62 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.94 
 
 		 287 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  39.09 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  38.78 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.53 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  41 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  41.51 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  41.76 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  40.78 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  41.76 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>