More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1326 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 
99 aa  196  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  72.73 
 
 
102 aa  145  2e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  68 
 
 
156 aa  139  2e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  65.62 
 
 
100 aa  137  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.39901e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 
104 aa  127  4e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  64.65 
 
 
104 aa  127  5e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  65.66 
 
 
104 aa  126  1e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  57.73 
 
 
100 aa  122  2e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  58 
 
 
104 aa  117  4e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  117  4e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  60 
 
 
102 aa  117  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 
102 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 
102 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 
102 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  59.6 
 
 
102 aa  112  1e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  59.6 
 
 
102 aa  113  1e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 
102 aa  112  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  57 
 
 
105 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  58 
 
 
103 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
103 aa  110  4e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
104 aa  110  7e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  109  1e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 
101 aa  108  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 
100 aa  107  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  106  9e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  54 
 
 
103 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  57 
 
 
103 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 
99 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.04369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  52 
 
 
114 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  56 
 
 
103 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.2148e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
104 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  55 
 
 
103 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
103 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  54 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  47.52 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.76664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.5429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  49 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  51 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.16286e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  93.6  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  93.2  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  52.08 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.47108e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  49.49 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  49 
 
 
103 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  6.37379e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>