More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0182 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 435 aa  900    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  67.13 
 
 		 439 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 436 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 424 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.86 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 422 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 423 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 422 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 431 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 431 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 427 aa  415  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 427 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>