More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  100 
 
 
136 aa  268  3e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  69.4 
 
 
303 aa  188  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  69.4 
 
 
303 aa  188  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  69.4 
 
 
303 aa  188  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  60.45 
 
 
177 aa  158  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 
184 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 
184 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  55.22 
 
 
304 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  63.33 
 
 
127 aa  129  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  52.99 
 
 
188 aa  125  2e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  54.14 
 
 
294 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  55.93 
 
 
145 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  51.47 
 
 
139 aa  118  2e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  51.47 
 
 
139 aa  118  2e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  50.74 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  50.74 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  50.74 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  50.74 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  50.74 
 
 
139 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  53.39 
 
 
256 aa  112  2e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  52.42 
 
 
124 aa  109  1e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  46.56 
 
 
131 aa  109  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  64.21 
 
 
103 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  45.93 
 
 
158 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  50 
 
 
124 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  54.26 
 
 
145 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  54.26 
 
 
287 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  47.62 
 
 
365 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  41.61 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  41.61 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  41.61 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  54.05 
 
 
79 aa  81.3  5e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  54.05 
 
 
79 aa  81.3  5e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
146 aa  79  2e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.81 
 
 
281 aa  78.6  3e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  51.22 
 
 
121 aa  78.2  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.55 
 
 
281 aa  78.6  3e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.06 
 
 
281 aa  76.6  1e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  40 
 
 
181 aa  73.9  7e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  35.34 
 
 
177 aa  71.2  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  35.34 
 
 
177 aa  71.2  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  35.34 
 
 
177 aa  71.2  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  35.34 
 
 
177 aa  71.2  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  35.34 
 
 
177 aa  71.2  4e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.06 
 
 
281 aa  71.6  4e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  36.84 
 
 
123 aa  70.5  7e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  35.82 
 
 
138 aa  69.7  1e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  35.82 
 
 
131 aa  69.7  1e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  37.04 
 
 
145 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 
151 aa  67.4  6e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 
151 aa  67.4  6e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 
151 aa  67.4  6e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  34.59 
 
 
260 aa  67  9e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  33.58 
 
 
159 aa  66.2  1e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  40.21 
 
 
135 aa  65.9  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  39.13 
 
 
260 aa  65.5  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  39.13 
 
 
260 aa  65.5  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  38 
 
 
113 aa  65.1  3e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  32.04 
 
 
250 aa  64.7  4e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.31811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  33.33 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  41.24 
 
 
102 aa  64.7  4e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  32.04 
 
 
250 aa  64.7  4e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  8.41064e-08 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  34 
 
 
255 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  32 
 
 
123 aa  64.3  6e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  34 
 
 
255 aa  64.3  6e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  37 
 
 
96 aa  63.9  7e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  63.9  7e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  33.58 
 
 
164 aa  63.9  7e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  36.09 
 
 
145 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  36.09 
 
 
145 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  37 
 
 
113 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  37 
 
 
113 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  37 
 
 
113 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  33.58 
 
 
164 aa  62.4  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  34.85 
 
 
266 aa  62.8  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  33.58 
 
 
164 aa  62.4  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4697  ISPs1, transposase OrfB  36.36 
 
 
112 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  33.58 
 
 
164 aa  62.4  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  33.58 
 
 
164 aa  62.4  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  30.08 
 
 
113 aa  62.8  2e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3980  hypothetical protein  39.29 
 
 
118 aa  62  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  29.85 
 
 
193 aa  62.4  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  31.3 
 
 
252 aa  62  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  30.08 
 
 
210 aa  62  3e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  62  3e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  30.08 
 
 
210 aa  62  3e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  30.08 
 
 
210 aa  62  3e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  36 
 
 
113 aa  61.6  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  29.85 
 
 
121 aa  61.2  4e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  31.3 
 
 
245 aa  61.6  4e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  32.58 
 
 
127 aa  61.2  5e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  60.8  5e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.8  6e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.8  6e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.8  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  30.6 
 
 
252 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>