More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2822 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  99.21 
 
 		 210 aa  259  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  99.21 
 
 		 210 aa  259  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  98.43 
 
 		 210 aa  258  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  66.93 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  66.93 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  67.77 
 
 		 252 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  52.07 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  52.07 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  52.07 
 
 		 254 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  49.59 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  49.59 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  49.59 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  49.59 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  49.59 
 
 		 254 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  49.59 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  49.59 
 
 		 138 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  45.9 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  49.49 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  48.48 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  44.83 
 
 		 255 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  42.86 
 
 		 251 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  38.71 
 
 		 252 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  37.7 
 
 		 260 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  37.7 
 
 		 260 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  37.7 
 
 		 260 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  37.7 
 
 		 260 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  39.82 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  41.28 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  42.02 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  42.02 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  42.02 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  42.02 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  41.18 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  41.18 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  36.8 
 
 		 249 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  40 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  40 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  40 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  40 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  40 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  40.37 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  40.37 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  40.37 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  39.52 
 
 		 245 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  40.37 
 
 		 113 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  38.64 
 
 		 171 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  39.67 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  36.75 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  38.71 
 
 		 249 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  39.2 
 
 		 250 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  39.2 
 
 		 250 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  42.74 
 
 		 259 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  38.02 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  37.39 
 
 		 251 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  37.39 
 
 		 251 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00500  transposase  33.61 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  38.84 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  38.84 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  38.84 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  38.84 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  38.02 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  37.88 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  37.88 
 
 		 171 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  44.94 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  32.79 
 
 		 249 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  32.79 
 
 		 249 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>