More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3758 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  95.35 
 
 		 186 aa  253  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  95.35 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  94.57 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  94.57 
 
 		 186 aa  250  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  94.57 
 
 		 186 aa  250  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  92.68 
 
 		 142 aa  237  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  90.7 
 
 		 129 aa  224  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 336 aa  223  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  79.07 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  78.29 
 
 		 129 aa  220  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  78.29 
 
 		 129 aa  220  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  79.07 
 
 		 129 aa  219  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  79.07 
 
 		 129 aa  219  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  78.29 
 
 		 129 aa  219  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  78.29 
 
 		 129 aa  219  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  78.29 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  76.74 
 
 		 129 aa  215  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  76.74 
 
 		 129 aa  215  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  76.74 
 
 		 129 aa  215  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  75.19 
 
 		 206 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  75.19 
 
 		 206 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  81.48 
 
 		 201 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  55.73 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  57.6 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  57.89 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  58.93 
 
 		 113 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  72.73 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  53.57 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  73.79 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  52.68 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  52.68 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  52.68 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  52.68 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  48.06 
 
 		 252 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  48.06 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  48.06 
 
 		 252 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  47.66 
 
 		 260 aa  115  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  56.52 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.19 
 
 		 252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.19 
 
 		 252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  57.78 
 
 		 106 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.27 
 
 		 260 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.27 
 
 		 260 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.27 
 
 		 260 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.27 
 
 		 260 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  43.75 
 
 		 251 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  43.75 
 
 		 251 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  68.12 
 
 		 254 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1439  hypothetical protein  63.77 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  41.09 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  41.09 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  41.09 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  41.09 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  41.09 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  43.31 
 
 		 266 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  49.12 
 
 		 260 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  49.12 
 
 		 260 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  42.64 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.06 
 
 		 251 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.8 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.8 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.8 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  43.41 
 
 		 176 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  39.37 
 
 		 254 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  43.41 
 
 		 176 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  39.37 
 
 		 254 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  39.37 
 
 		 254 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>