More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1352 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  99.39 
 
 		 164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  81.94 
 
 		 266 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 135 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  46.85 
 
 		 249 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  47.8 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  47.8 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  47.8 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  47.8 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  47.8 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  45.45 
 
 		 249 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  48.98 
 
 		 253 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  48.98 
 
 		 253 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  48.98 
 
 		 253 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  48.98 
 
 		 253 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  48.61 
 
 		 253 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  43.11 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  43.11 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  42.51 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  42.51 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  46.26 
 
 		 259 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  44.06 
 
 		 255 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  52.68 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  47.73 
 
 		 235 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  47.33 
 
 		 193 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  50.89 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.54 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.59 
 
 		 260 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  41.84 
 
 		 252 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  40.91 
 
 		 210 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  40.91 
 
 		 210 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.59 
 
 		 260 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  45.21 
 
 		 260 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  41.89 
 
 		 210 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.59 
 
 		 260 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.59 
 
 		 260 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.18 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.18 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  44.22 
 
 		 252 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  44.22 
 
 		 252 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  42 
 
 		 336 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  41.21 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  42.76 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  42.67 
 
 		 251 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  42.67 
 
 		 251 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  39.72 
 
 		 252 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  57.14 
 
 		 96 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  39.22 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  39.22 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  41.01 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  45.69 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  46.09 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  38.56 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  43.38 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  44.85 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  44.85 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  45.31 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  45.31 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  44.78 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  49.14 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  49.14 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  49.14 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  39.6 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  46.67 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  49.14 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>