More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0548 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  97.54 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  87.5 
 
 		 253 aa  239  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  86.72 
 
 		 253 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  86.72 
 
 		 253 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  86.72 
 
 		 253 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  86.72 
 
 		 253 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  48.82 
 
 		 176 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  48.82 
 
 		 176 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  48.03 
 
 		 176 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  48.03 
 
 		 176 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  46.97 
 
 		 252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  45.38 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  47.93 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  47.93 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  42.31 
 
 		 249 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  46.09 
 
 		 266 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  42.64 
 
 		 249 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  43.31 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  43.31 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  43.31 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  43.31 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  43.31 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  46.88 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  41.54 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  44.53 
 
 		 245 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  46.09 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  46.09 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  46.09 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  46.09 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  42.97 
 
 		 252 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 336 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  42.64 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  43.41 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  46.43 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  41.86 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  41.86 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  41.86 
 
 		 190 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  43.85 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>