More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0537 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 121 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  82.91 
 
 		 115 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  77.95 
 
 		 235 aa  198  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4249  transposase, IS4 family protein  77.08 
 
 		 129 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4820  hypothetical protein  85.33 
 
 		 103 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  42.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  42.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  42.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  42.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  42.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  47.33 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  47.33 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  47.33 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  47.33 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  47.33 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  46.56 
 
 		 135 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  45.8 
 
 		 266 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  41.98 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  40.46 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  39.61 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  38.96 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  39.61 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  38.96 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  42.97 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  50.48 
 
 		 123 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  41.38 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  44.54 
 
 		 128 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  43.28 
 
 		 260 aa  101  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.17 
 
 		 253 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  41.96 
 
 		 113 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  41.96 
 
 		 113 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  40.8 
 
 		 149 aa  99  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  41.96 
 
 		 113 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  43.44 
 
 		 122 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 		 113 aa  98.2  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  43.44 
 
 		 157 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  97.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  97.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  34.38 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  34.38 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  34.38 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  39.66 
 
 		 122 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  38.71 
 
 		 128 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  37.4 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  42.02 
 
 		 128 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  42.42 
 
 		 142 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  42.42 
 
 		 142 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  43.65 
 
 		 129 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  42.19 
 
 		 249 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  43.65 
 
 		 129 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  39.29 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  42.06 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  42.06 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  39.39 
 
 		 138 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  41.04 
 
 		 260 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  41.04 
 
 		 260 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  43.65 
 
 		 336 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  41.04 
 
 		 260 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  41.04 
 
 		 260 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  91.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  38.81 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>