More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0101 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
128 aa  265  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  85.94 
 
 
128 aa  233  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  85.94 
 
 
128 aa  233  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  75.78 
 
 
128 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  96.94 
 
 
108 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  72.66 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  72.66 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  72.66 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  53.66 
 
 
123 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  41.6 
 
 
177 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  41.6 
 
 
177 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  41.6 
 
 
177 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  41.6 
 
 
177 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  41.6 
 
 
177 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  40.65 
 
 
235 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  42.02 
 
 
193 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  39.13 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  40 
 
 
122 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  38.4 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  40.48 
 
 
210 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  40.62 
 
 
249 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  39.68 
 
 
210 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  39.68 
 
 
210 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  39.06 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  37.6 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  39.2 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  39.2 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  39.2 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  39.2 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  38.74 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1764  transposase OrfB  40.16 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246396  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  38.89 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  38.1 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  38.21 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  37.61 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  38.21 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  38.21 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  38.21 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  38.21 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  38.98 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.72 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  33.6 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.72 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.96 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  33.03 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  33.03 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  39.42 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  39.42 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  39.42 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  39.42 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  39.42 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  37.72 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>