More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7001 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  77.34 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  77.34 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  75.78 
 
 		 128 aa  205  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  58.54 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  70.41 
 
 		 108 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  44.8 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  44.8 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  44.8 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  44.8 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  44.8 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  44.54 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  42.97 
 
 		 249 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  41.46 
 
 		 235 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  41.41 
 
 		 249 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  41.74 
 
 		 121 aa  95.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  39.47 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  38.76 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  40 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  40 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  40 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  40 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  37.6 
 
 		 253 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  37.6 
 
 		 253 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  37.6 
 
 		 253 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  37.6 
 
 		 253 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  42.34 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  42.06 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.8 
 
 		 253 aa  87.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  41.27 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  39.83 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  39.83 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  39.84 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  39.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  39.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  39.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  39.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  36 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1764  transposase OrfB  39.23 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.4 
 
 		 252 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  37.3 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  37.3 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  37.3 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  38.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  38.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  38.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  38.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  38.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  36.59 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  34.13 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  34.13 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  34.13 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  34.13 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>