More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4244 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  100 
 
 
128 aa  259  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  100 
 
 
128 aa  259  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  100 
 
 
128 aa  259  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  79.69 
 
 
128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  72.66 
 
 
128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  70.31 
 
 
128 aa  187  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  70.31 
 
 
128 aa  187  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  69.39 
 
 
108 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  55.28 
 
 
123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  43.75 
 
 
249 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  42.19 
 
 
249 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  40.8 
 
 
177 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  40.8 
 
 
177 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  40.8 
 
 
177 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  40.8 
 
 
177 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  40.8 
 
 
177 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
193 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  39.02 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
121 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  36.43 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  36.84 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.72 
 
 
253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  36.94 
 
 
113 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  35.94 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  42.64 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  40.54 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  41.86 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  40.48 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  37.3 
 
 
210 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  40.48 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  37.3 
 
 
210 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  37.3 
 
 
210 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  39.68 
 
 
176 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  39.68 
 
 
176 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  38.35 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  38.35 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  38.35 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  38.35 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1764  transposase OrfB  37.69 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  38.14 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  40.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  40.34 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  37.72 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  37.72 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  37.72 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  37.72 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  33.86 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  33.86 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  37.72 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  34.88 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  34.88 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  38.6 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  33.07 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.59 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  35.16 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  35.16 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  34.92 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  34.92 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  35.16 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  35.16 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>