More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7095 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1158  transposase  100 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  100 
 
 		 131 aa  207  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  72.28 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  71.72 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  71.29 
 
 		 254 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  71.29 
 
 		 254 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  71.29 
 
 		 254 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  71.29 
 
 		 254 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  71.29 
 
 		 254 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  73.27 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  73.27 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.44 
 
 		 252 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0528  ISBm1, transposase orfB, interruption-C  73.24 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.300316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  53.54 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  53.54 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  49.49 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  49.49 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  49.49 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  49.49 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  50.54 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  48.48 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  48.48 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  45.83 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  45.83 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  45.83 
 
 		 157 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  45.83 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  44.79 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  44.79 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.3 
 
 		 251 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  45.36 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  51.11 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  51.11 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  44.21 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  48.45 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  47.37 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  47.37 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  47.37 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  47.37 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  47.37 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  42.22 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  41.41 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  42.42 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  53.75 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  44.83 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  43.01 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.19 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.19 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  43.01 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.19 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.19 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  45.83 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  40 
 
 		 249 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  43.33 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  44.83 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  44.83 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  43.82 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  44.79 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  44.79 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  38.53 
 
 		 188 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  46.43 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  40.43 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  40.43 
 
 		 255 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  38.53 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  37.23 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  37.4 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  37.36 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  43.37 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  43.37 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  43.37 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  43.37 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>