More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1127 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  100 
 
 		 102 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  84.16 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  82.18 
 
 		 254 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  82.18 
 
 		 254 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  82.18 
 
 		 254 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  82.18 
 
 		 254 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  82.18 
 
 		 254 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  71.72 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  71.72 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  71.72 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  83 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  83 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  57.58 
 
 		 252 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0528  ISBm1, transposase orfB, interruption-C  78.38 
 
 		 79 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.300316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  48.98 
 
 		 210 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  48.98 
 
 		 210 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  48.48 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  48.98 
 
 		 210 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  45.45 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  45.45 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  45.45 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  45.45 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 113 aa  87  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  47.31 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  51.11 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  51.11 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  48.86 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  47.06 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  47.47 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  47.47 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  47.47 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  47.47 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  47.47 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  48.86 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  45.92 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  45.92 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  45.92 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  45.92 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  50.63 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  44.9 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  44.9 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1962  hypothetical protein  53.49 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  52.5 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  52.7 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  46.59 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  46.59 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  42.42 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  41.84 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  50 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  40.82 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  41.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  41.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  41.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  41.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  44.19 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  35.71 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  40.82 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  38.54 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  37 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  39.18 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  39.18 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>