276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0528 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0528  ISBm1, transposase orfB, interruption-C  100 
 
 
79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.300316  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  89.47 
 
 
254 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  89.47 
 
 
254 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  89.47 
 
 
254 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  89.47 
 
 
254 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  89.47 
 
 
254 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  82.89 
 
 
254 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  93.85 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  93.85 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  78.38 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  73.24 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  73.24 
 
 
131 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  73.24 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.95 
 
 
252 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  55.41 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  55.41 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  51.39 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  51.39 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  50 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  51.39 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  55.38 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  55.38 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  55.38 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  56.25 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  55.38 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  53.85 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  53.03 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  53.03 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  58.18 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  51.56 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  50.72 
 
 
251 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  55.56 
 
 
255 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  45.31 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  50.72 
 
 
251 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  44.59 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  50.72 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  49.28 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  49.28 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  49.28 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  49.28 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  49.28 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  50.75 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  43.06 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  55.1 
 
 
251 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  44.44 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  41.94 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  44.12 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  45.9 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  45.9 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  45.9 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  48.57 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4668  transposase, IS4  68.42 
 
 
40 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.371042  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  40.28 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  40.28 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  40.28 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  40.28 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  63.41 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  42.47 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  41.67 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  41.67 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  41.67 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  38.03 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  41.67 
 
 
253 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  37.5 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  37.5 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  37.5 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  37.5 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  41.67 
 
 
253 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1962  hypothetical protein  80.65 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.44 
 
 
251 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  36.62 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  36.62 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  36.62 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  36.62 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  38.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  35.53 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0078  putative transposase  40.62 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  47.14 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  47.14 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  40.62 
 
 
266 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  50 
 
 
188 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  35.14 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  45.83 
 
 
79 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  45.83 
 
 
79 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  40.28 
 
 
116 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  38.89 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  38.36 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  38.36 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>