More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6121 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  98.84 
 
 
251 aa  176  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  98.84 
 
 
251 aa  176  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  100 
 
 
86 aa  176  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  70.93 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  53.49 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  53.49 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  53.49 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  53.49 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  52.33 
 
 
131 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  55.81 
 
 
92 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  51.16 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  53.49 
 
 
260 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  56.96 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  57.5 
 
 
254 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  57.5 
 
 
254 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  51.16 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  51.16 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  57.5 
 
 
254 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  57.5 
 
 
254 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  57.5 
 
 
254 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  48.84 
 
 
113 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  48.84 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  51.85 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  53.49 
 
 
260 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  53.49 
 
 
260 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  52.33 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  51.85 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  51.85 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  51.85 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  53.49 
 
 
260 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  53.49 
 
 
260 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  52.33 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  51.85 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  51.76 
 
 
135 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  51.9 
 
 
113 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  50.59 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  48.19 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  48.19 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  55 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  51.76 
 
 
252 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  51.76 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  51.9 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  51.76 
 
 
252 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  47.67 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  47.67 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  50.62 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  50.62 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  49.38 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  49.38 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  47.67 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  49.38 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  49.38 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  49.38 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  47.67 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
336 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  58.02 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  58.02 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>