More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1377 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2843  hypothetical protein  61.04 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  47.31 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  47.31 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  45.16 
 
 
113 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  46.24 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  46.24 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  46.24 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  46.24 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  44.09 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  44.09 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  44.09 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  47.25 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  45.56 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  43.01 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  44.44 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  44.09 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  44.09 
 
 
193 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  43.01 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  46.59 
 
 
254 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  46.51 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2402  hypothetical protein  62.69 
 
 
68 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  44.57 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  45.16 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  46.51 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  45.45 
 
 
254 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  45.45 
 
 
254 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  45.45 
 
 
254 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  45.45 
 
 
254 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  45.45 
 
 
254 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  46.51 
 
 
260 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  46.51 
 
 
260 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  46.51 
 
 
260 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  46.51 
 
 
260 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  40.45 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  45.65 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  40.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  40.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  40.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  40.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  40.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  46.59 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.49 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  44.58 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  43.82 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  43.82 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  46.59 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  41.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  44.19 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  44.19 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  44.44 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  48.15 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  45.95 
 
 
94 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  44.19 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  42.7 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  48.15 
 
 
336 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  44.19 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>