154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2402 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2402  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  62.69 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  62.69 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  42.86 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  41.27 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  42.62 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  41.94 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  41.94 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  41.94 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  41.94 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  41.94 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  41.94 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2843  hypothetical protein  46.67 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  41.27 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1015  ISCc1, transposase OrfB  40.98 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  46.03 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  42.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  42.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  42.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  42.62 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  44.26 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  39.22 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  45.9 
 
 
266 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  41.51 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  42.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  42.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  42.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  42.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.62 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  39.66 
 
 
255 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  39.22 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  39.06 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  40.32 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  40.32 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  40.32 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0078  putative transposase  42.62 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  41.94 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  40.32 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  40.32 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  40.32 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  40.32 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  40.32 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
250 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
250 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  38.98 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.5 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.5 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.5 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.5 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.5 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  44.68 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  38.33 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  36.76 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  37.93 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  38.33 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  39.34 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  34.38 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  34.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  39.06 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  42.55 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  42.55 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  32.81 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  32.81 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  32.81 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  32.81 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  34.67 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  34.85 
 
 
115 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  36.76 
 
 
171 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  36.76 
 
 
171 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  34.38 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  40.98 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  40.98 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  40.98 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  40.98 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0215  IS4 family transposase  35.48 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02536  ISXoo11 transposase  43.14 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>