More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2843 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2843  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  235  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  61.04 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  61.04 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4820  hypothetical protein  53.7 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  45.59 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  42.86 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  40.79 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  40.79 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  40.79 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  40.79 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  40.79 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  43.55 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  39.47 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  39.47 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  41.1 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.67 
 
 
260 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  41.56 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  44.83 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  34.21 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  34.21 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  34.21 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  34.21 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  43.42 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  41.79 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  36.49 
 
 
255 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  37.65 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  33.77 
 
 
251 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  38.16 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  36.84 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  36.84 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  41.56 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  40.79 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  43.84 
 
 
119 aa  57  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  40.79 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  44.44 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  40.79 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  40.79 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  40.79 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  40.79 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  40.79 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
252 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  35.29 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  44.44 
 
 
249 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  39.73 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  39.73 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  37.18 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  37.18 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  37.18 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  37.18 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  37.18 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  31.58 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  36.26 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  36.26 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  34.52 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
336 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  41.54 
 
 
245 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  40.26 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  38.96 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  39.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  39.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>