More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0531 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  100 
 
 
146 aa  235  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  100 
 
 
113 aa  234  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  77.17 
 
 
112 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  77.17 
 
 
112 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  77.17 
 
 
112 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  77.17 
 
 
112 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  76.09 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  77.27 
 
 
131 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  66.3 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  66.3 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  59.78 
 
 
129 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  59.78 
 
 
129 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 
129 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 
129 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  58.7 
 
 
129 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  58.7 
 
 
186 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  58.7 
 
 
186 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  58.7 
 
 
186 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  57.61 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  57.61 
 
 
129 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  57.61 
 
 
129 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  57.61 
 
 
129 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  56.52 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  56.52 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
336 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  55.56 
 
 
142 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  56.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  56.52 
 
 
201 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  55.43 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  55.43 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  55.43 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  59.78 
 
 
206 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  59.78 
 
 
206 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  57.61 
 
 
129 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  56.67 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  56.67 
 
 
110 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  59.3 
 
 
260 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  59.3 
 
 
260 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  59.3 
 
 
260 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  59.3 
 
 
260 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  52.94 
 
 
260 aa  86.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  45.16 
 
 
251 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  45.16 
 
 
251 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.57 
 
 
251 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  48.19 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  47.56 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  48.19 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  45.65 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  45.65 
 
 
252 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  45.65 
 
 
252 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  47.06 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  48.84 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  59.65 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  41.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  41.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  41.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  41.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  41.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  40.7 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  43.33 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  41.57 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.39 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.39 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  42.22 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  42.22 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  42.22 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  42.22 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  46.34 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  46.34 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  46.34 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  46.34 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>