More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3433 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  100 
 
 		 91 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  82.95 
 
 		 255 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  74.16 
 
 		 251 aa  140  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2246  ISBm1, transposase orfB, degenerate  76.67 
 
 		 203 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  61.45 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  60.24 
 
 		 113 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  61.45 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  61.45 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  61.45 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  81.82 
 
 		 94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  61.45 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  61.45 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  59.04 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  59.04 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  59.04 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  59.04 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  59.04 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  51.25 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  58.23 
 
 		 251 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  58.23 
 
 		 251 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  54.43 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  54.43 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  56.96 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  46.84 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  45.57 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  45.57 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  45.57 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  45.57 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  53.09 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  53.09 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  53.09 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  53.09 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  53.09 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  45.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  45.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  45.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  45.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  54.05 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  45.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  54.32 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  42.05 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  47.56 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  45.57 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  45.57 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  45.57 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  45.57 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  45.57 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  42.05 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  56.76 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  56.76 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  51.25 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  43.9 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  43.9 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  43.9 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  43.9 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  41.33 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  52.7 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  46.91 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  46.43 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  48.1 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  48.1 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  48.1 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  47.06 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  48.1 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  42.68 
 
 		 259 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  48.75 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  48.75 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  46.34 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  46.43 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  48.1 
 
 		 252 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  48.1 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  48.1 
 
 		 252 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  41.98 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  45.68 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  46.43 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  54.55 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  45.88 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  45.88 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  48.61 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  45.78 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.51 
 
 		 251 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  40.74 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  45.56 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  45.78 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  45.78 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>