More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11059 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11059  transposase  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  99.31 
 
 
287 aa  293  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  55.15 
 
 
365 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  50.38 
 
 
303 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  50.38 
 
 
303 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  50.38 
 
 
303 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  48.44 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  48.36 
 
 
256 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  46.04 
 
 
177 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  46.53 
 
 
184 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  46.53 
 
 
184 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  55.32 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  47.46 
 
 
304 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  43.51 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  42.96 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  51.52 
 
 
294 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  43.94 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  43.94 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  42.31 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  43.18 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  43.18 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  43.18 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  43.18 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  43.18 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3079  hypothetical protein  54.17 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  45.79 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  54.26 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  51.52 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  51.52 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4189  putative transposase  50.68 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4225  putative transposase  50.68 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  40 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  40 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  37.98 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  37.98 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  37.98 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  44.33 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  38.54 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  37.12 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  33.59 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  38.54 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  36.84 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  38.3 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
336 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.16 
 
 
251 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  34.85 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  34.85 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  31.78 
 
 
255 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  35.11 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  34.11 
 
 
201 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.55 
 
 
260 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  37.89 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  34.09 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  32.56 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  43.3 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  34.09 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  34.09 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  32.56 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  36 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  30.95 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>