29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4651 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 1124 aa  2213    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  38.05 
 
 		 1091 aa  174  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  27.2 
 
 		 1079 aa  139  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1090 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  31.86 
 
 		 969 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1002 aa  125  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  26.69 
 
 		 1086 aa  125  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  27.73 
 
 		 1385 aa  121  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 1051 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  32.79 
 
 		 628 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 356 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  33.45 
 
 		 994 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1655 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.1 
 
 		 992 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  26 
 
 		 1041 aa  78.2  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.71 
 
 		 988 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  35.48 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  27.84 
 
 		 1147 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  50 
 
 		 935 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5953  hypothetical protein  26.32 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5550  hypothetical protein  26.32 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  46.15 
 
 		 1066 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 407 aa  52  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 304 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 380 aa  49.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1017 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.33 
 
 		 389 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  29.23 
 
 		 212 aa  45.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 343 aa  45.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>