More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2725 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  62.18 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  48.24 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  51.77 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.4 
 
 		 338 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  46.23 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 333 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  48.73 
 
 		 323 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  49.68 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  46.13 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  48.71 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  47.91 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  42.07 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 346 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 347 aa  238  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  43.48 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.82 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  44.08 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  46.65 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  43.41 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  40.19 
 
 		 333 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  40.71 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  43.09 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  40.71 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  41.99 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  42.24 
 
 		 326 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  42.24 
 
 		 326 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  40.58 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  47.87 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  43.83 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  43.09 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  40.19 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  41.99 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  38.91 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  41.01 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  44.72 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 362 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4584  transcriptional activator FtrA  41.33 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  37.25 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  40.67 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  43.31 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  38.92 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  39.25 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  38.8 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.08 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  38.99 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>