More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0708 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 438 aa  873    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  69.34 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  70.78 
 
 		 436 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  69.18 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  69.2 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  67.27 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  68.43 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  67.52 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  66.59 
 
 		 439 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  66.82 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  68.19 
 
 		 436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  66.67 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  63.43 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  63.43 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  65.15 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  65.4 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  65.9 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  63.93 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  65.21 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  63.01 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  62.65 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  62.41 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  62.84 
 
 		 436 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  62.79 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  61.07 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  60.41 
 
 		 441 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.82 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  59.78 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  60.22 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  60.22 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  59.14 
 
 		 441 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  60.22 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  60.54 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  59.06 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  55.94 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  59.06 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  59.47 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  56.55 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  58.39 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  55.89 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  50.91 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  49.43 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.66 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  49.41 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.66 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  48.04 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  48.63 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  47.72 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.94 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.39 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.25 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.73 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  46.7 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.44 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  46.47 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.61 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  47.21 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  46.85 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  47.7 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.35 
 
 		 442 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.47 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.53 
 
 		 419 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  44.22 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.93 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  46.1 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  45.81 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 		 448 aa  354  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 		 443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  44.11 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  45.77 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  45.96 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.94 
 
 		 446 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  46.42 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.16 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  44.06 
 
 		 426 aa  345  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 446 aa  345  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  47.47 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 		 446 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  44.75 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.03 
 
 		 443 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.03 
 
 		 443 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.7 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  45.54 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>