More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0016 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
377 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
376 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  36.99 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  37.62 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  43.07 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  43.97 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  41.98 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.12 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  34.02 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  37.85 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  37.85 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  37.85 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.15 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  42.86 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
756 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  37.75 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.83 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  35.44 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.76 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  31.13 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  33.57 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  36.49 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  41.09 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  40.6 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.49 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.34 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  38.97 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
856 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.72 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  30.77 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.58 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 
773 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  40.56 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  36.17 
 
 
769 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>