More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0715 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  100 
 
 		 204 aa  387  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  64.68 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  66.83 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  63.32 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  62.63 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  61.88 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  61.88 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  55.07 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  51.9 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  50.95 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  57.56 
 
 		 208 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  56.06 
 
 		 219 aa  188  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  56.06 
 
 		 219 aa  187  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  56.04 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  54.11 
 
 		 212 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  52.91 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  54.33 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  54.11 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  54.23 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  53.62 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  52.66 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  51.67 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  50.72 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  55.28 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  53.69 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  52.88 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  51.96 
 
 		 222 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  53.55 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  52.97 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  50 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  54.21 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  54.21 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  36.45 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  53.68 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.33 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  55.5 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.5 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  38.86 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.95 
 
 		 674 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  36.04 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 232 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  43.5 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  39.27 
 
 		 679 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.09 
 
 		 673 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  36 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 231 aa  141  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.09 
 
 		 673 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  37.33 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.65 
 
 		 699 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  36.94 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  34.42 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  36.94 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>