More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0052 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3600  cysteinyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 498 aa  688    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1825  cysteinyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 		 498 aa  705    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2181  cysteinyl-tRNA synthetase  75.56 
 
 		 494 aa  759    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.599658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0052  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 496 aa  1008    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.227151  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0291  cysteinyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.201946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 458 aa  364  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 468 aa  362  9e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 457 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 466 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 478 aa  352  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 480 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 494 aa  350  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 500 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 475 aa  349  7e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 478 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 493 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 474 aa  338  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 459 aa  336  7e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 472 aa  335  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 459 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>