More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0516 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
590 aa  1158    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  37.65 
 
 
296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  32.75 
 
 
423 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  35.86 
 
 
335 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  37.66 
 
 
324 aa  150  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  37.23 
 
 
324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
324 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  36.24 
 
 
324 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  35.06 
 
 
308 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  37.12 
 
 
335 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  37.16 
 
 
362 aa  137  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  37.24 
 
 
303 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
332 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  32.82 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.63 
 
 
335 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.69 
 
 
362 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  29.15 
 
 
369 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  34.81 
 
 
388 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  33.46 
 
 
348 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.33 
 
 
364 aa  124  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  30.18 
 
 
383 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  31.98 
 
 
320 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  32.32 
 
 
325 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.38 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  32.71 
 
 
363 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  35.19 
 
 
361 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  32.79 
 
 
351 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.63 
 
 
385 aa  120  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.53 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  32.89 
 
 
320 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.46 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.85 
 
 
325 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  31.52 
 
 
336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  29.47 
 
 
357 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  31.82 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  29.96 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  34.08 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  34.74 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.13 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.33 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  30.7 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  34.53 
 
 
362 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  30.7 
 
 
320 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  34.21 
 
 
360 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  30.7 
 
 
320 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  34.19 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  34.08 
 
 
366 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  33.85 
 
 
353 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  30.68 
 
 
335 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  31.92 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.46 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  33.59 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  32.02 
 
 
320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  31.84 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  32.2 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  32.2 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  32.58 
 
 
358 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.78 
 
 
374 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.2 
 
 
374 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
367 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  31.98 
 
 
376 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  33.2 
 
 
372 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  33.2 
 
 
372 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  33.2 
 
 
372 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  30.08 
 
 
367 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  32.22 
 
 
356 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  31.37 
 
 
403 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.58 
 
 
291 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  32.82 
 
 
324 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  32.62 
 
 
350 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  31.36 
 
 
374 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 
353 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  31.52 
 
 
363 aa  107  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  32.31 
 
 
371 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  28.72 
 
 
376 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  31.98 
 
 
381 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.24 
 
 
330 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
363 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.24 
 
 
353 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  30.63 
 
 
374 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
329 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  31.74 
 
 
342 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  31.98 
 
 
380 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  31.74 
 
 
342 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  32.64 
 
 
330 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  27.49 
 
 
377 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
372 aa  104  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  31.91 
 
 
344 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.88 
 
 
372 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 
336 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.92 
 
 
367 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  29.51 
 
 
356 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>