56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1799 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  58.29 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  50.86 
 
 		 183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  50.86 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  50.86 
 
 		 183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  50.87 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  50.87 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  51.95 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  51.3 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  51.72 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  47.77 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  47.77 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  46.45 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  45.45 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  44.05 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  40.98 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  40.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  40.44 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  37.72 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  30.07 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.1 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.23 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  25.61 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  36.36 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  27.11 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.78 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.47 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  30.3 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  29.63 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  36.26 
 
 		 397 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.57 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  35.44 
 
 		 397 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  38.55 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  25.33 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  34.15 
 
 		 406 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.71 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.5 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  28.8 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  34.57 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.32 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  25.56 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  35.62 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  31.82 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 397 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  32.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  32.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  32.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  38.33 
 
 		 572 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  26.89 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  31.33 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  24 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>