118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1123 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  57.5 
 
 
200 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  60 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  60 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  44.5 
 
 
201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.7 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  40.67 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  40.8 
 
 
214 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.52 
 
 
259 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  36.04 
 
 
208 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.14 
 
 
233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.32 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.5 
 
 
211 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  34.67 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.84 
 
 
210 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  35 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.41 
 
 
256 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.26 
 
 
220 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.68 
 
 
219 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.62 
 
 
205 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.68 
 
 
219 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
229 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  36.77 
 
 
230 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  34.18 
 
 
220 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  30.41 
 
 
208 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.04 
 
 
224 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  30.41 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  30.41 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  30.41 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  30.41 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.65 
 
 
222 aa  99  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  29.02 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.75 
 
 
218 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  28.86 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.34 
 
 
233 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  29 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.95 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.65 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  31.44 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  31.44 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  31.44 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  31.44 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  33.53 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  31.43 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  31.44 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  33.53 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  33.53 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.04 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  28.36 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.65 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.7 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  28.08 
 
 
215 aa  91.3  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  29.85 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.86 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.58 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  32.16 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  32.82 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.82 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  36.29 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  32.82 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  30.1 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  32.31 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  30.21 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  33.5 
 
 
211 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  35.81 
 
 
209 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.57 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  32.43 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  36.28 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  36.28 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.21 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  35.11 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.15 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  28.88 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.23 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  36.56 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.26 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  25.55 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  31.63 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  35.48 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.83 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.49 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  21.76 
 
 
344 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  22.63 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.27 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  33 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.56 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.21 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  25 
 
 
218 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  19.37 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.66 
 
 
368 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  29.55 
 
 
373 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.41 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  29 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>