44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3182 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  100 
 
 
161 aa  313  8e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  60.69 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  58.82 
 
 
176 aa  161  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  56.55 
 
 
164 aa  160  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  50.58 
 
 
189 aa  154  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  49.3 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  49.66 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  42.48 
 
 
164 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  45.45 
 
 
184 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  39.35 
 
 
606 aa  101  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  39.19 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  37.24 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  35.86 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  34.69 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  32.67 
 
 
649 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.29 
 
 
649 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.86 
 
 
649 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  34.25 
 
 
615 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.89 
 
 
649 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  34 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.65 
 
 
652 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  29.85 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  36.42 
 
 
590 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.48 
 
 
608 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.26 
 
 
582 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.25 
 
 
633 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  40.74 
 
 
566 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.19 
 
 
585 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  33.33 
 
 
626 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.86 
 
 
580 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  36.78 
 
 
634 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  37.74 
 
 
602 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  32.11 
 
 
538 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  30.52 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  30.5 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  42.37 
 
 
466 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  33.33 
 
 
600 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  40 
 
 
538 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  42.31 
 
 
60 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  27.97 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  38.33 
 
 
538 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  30.5 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  32.93 
 
 
469 aa  40.8  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>