53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1829 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  75.71 
 
 		 247 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  73.2 
 
 		 250 aa  363  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  72 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  68.55 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  54.66 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  52.61 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  53.04 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  48.4 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  47.2 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  48.58 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  47.79 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  48.81 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  50.2 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  46.64 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  48.61 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  47.41 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.63 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  44.58 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  45.24 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  43.95 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  43.27 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  41.94 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  43.82 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  41.43 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  35.63 
 
 		 387 aa  145  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  37.97 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  35.46 
 
 		 397 aa  141  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  36.14 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  37.05 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  35.51 
 
 		 372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  36.88 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  32.73 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  32.73 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  33.09 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  30.36 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  31.62 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  25.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  29.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  34.75 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  26.18 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  33.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  25.54 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  26.52 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  26.84 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  30.82 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  27.75 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  30.82 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  30.82 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  30.77 
 
 		 206 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  31.11 
 
 		 207 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>