54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0211 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  90.4 
 
 
250 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  74.4 
 
 
248 aa  374  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  72 
 
 
247 aa  357  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  70.4 
 
 
247 aa  345  5e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  57.09 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  54.73 
 
 
253 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  51.98 
 
 
251 aa  247  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  52.21 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 
248 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 
249 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  49.21 
 
 
249 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  47.81 
 
 
252 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
252 aa  221  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  48.22 
 
 
278 aa  222  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
247 aa  221  6e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
252 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  49.4 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  46.18 
 
 
267 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  46.43 
 
 
267 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  47.13 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  45.9 
 
 
284 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  44.76 
 
 
285 aa  188  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  41.2 
 
 
254 aa  187  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  44.67 
 
 
281 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  45.38 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  35.86 
 
 
397 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  35.54 
 
 
363 aa  148  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  33.2 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  35.89 
 
 
363 aa  135  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  38.87 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  33.74 
 
 
372 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  35.38 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  36.22 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  26.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  26.54 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  31.03 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  26.54 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  31.03 
 
 
211 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  31.06 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  32.37 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  32.37 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  32.76 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  24.36 
 
 
206 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  32 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  27.17 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  27.59 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  27.65 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  26.59 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  27.65 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  26.59 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  31.78 
 
 
210 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  34.43 
 
 
206 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>