46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0808 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  45.91 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  41.96 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  39.45 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  39.84 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  43.25 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  42.46 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  42.58 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  39.84 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  39.76 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  40.87 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  42.06 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  38.89 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  40.32 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  40.49 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  38.89 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  39.29 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  39.6 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  37.74 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  40 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  39.75 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  40.47 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  38.87 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  34.88 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  38.04 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  37.65 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  37.7 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  36.19 
 
 		 397 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  37.45 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  36.73 
 
 		 363 aa  141  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  37.5 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  31.76 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  31.47 
 
 		 372 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  25.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  25.57 
 
 		 207 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  31.11 
 
 		 206 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1703  50S ribosomal protein L4  30.22 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1874  50S ribosomal protein L4  30.22 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00023713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  26.58 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  25.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1031  50S ribosomal protein L4  28.18 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000585543  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0085  50S ribosomal protein L4  29.58 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000177628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2080  50S ribosomal protein L4  29.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000375647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0354  50S ribosomal protein L4  28.18 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000523614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  24.81 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  24.81 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>