34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0533 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  73.97 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  69.92 
 
 		 249 aa  357  9e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  68.83 
 
 		 249 aa  343  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  59.5 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  58.23 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  54.66 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  52.4 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  49.6 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  49.8 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  49.01 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  47.2 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  48.02 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  46.83 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  46.03 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  46.03 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  44.22 
 
 		 278 aa  201  7e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  45.63 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  45.63 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  43.65 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  45.02 
 
 		 285 aa  184  8e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  45.34 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  41.9 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  42.69 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  43.08 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  38.96 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  37.05 
 
 		 387 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  35.8 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  38.89 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  34.13 
 
 		 397 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  35.46 
 
 		 363 aa  122  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  36.33 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  25.1 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>