37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01920 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  100 
 
 		 363 aa  737    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  67.15 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  58.55 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  59.57 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  54.97 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  37.98 
 
 		 253 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  37.6 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  37.74 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  37.74 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  37.35 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  38.65 
 
 		 251 aa  169  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  37.75 
 
 		 278 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  36.58 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  37.6 
 
 		 249 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  34.88 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  36.25 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  37.55 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  36.61 
 
 		 248 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  35.08 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  35.46 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  33.59 
 
 		 263 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  34.27 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  36.72 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  34.54 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  34.25 
 
 		 267 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  33.85 
 
 		 252 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  34.3 
 
 		 249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  33.46 
 
 		 252 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  35.18 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  34.24 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  32.41 
 
 		 254 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  34.27 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  32.14 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  25.48 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  24.14 
 
 		 208 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  22.87 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>